Ubikvitín je malý regulačný proteín, ktorý sa nachádza vo väčšine tkanív eukaryotických organizmov, t. j. vyskytuje sa všade. Štyri gény v ľudskom genóme kódujú ubikvitín: UBB, UBC, UBA52 a RPS27A.
Pridanie ubikvitínu k substrátovému proteínu sa nazýva ubikvitinácia . Ubikvitinácia ovplyvňuje proteíny mnohými spôsobmi: môže ich označiť na degradáciu prostredníctvom proteazómu, zmeniť ich bunkovú polohu, ovplyvniť ich aktivitu a podporiť alebo zabrániť interakcii proteínov. Ubikvitinácia zahŕňa tri hlavné kroky: aktiváciu, konjugáciu a ligáciu, ktoré vykonávajú ubikvitín-aktivujúce enzýmy (E1), ubikvitín-konjugujúce enzýmy (E2) a ubikvitín ligázy (E3). Výsledkom tejto sekvenčnej kaskády je naviazanie ubikvitínu na lyzínové zvyšky na proteínovom substráte prostredníctvom izopeptidovej väzby, na cysteínové zvyšky prostredníctvom tioesterovej väzby, na serínové a treonínové zvyšky prostredníctvom esterovej väzby alebo na aminoskupinu N-konca proteínu prostredníctvom peptidovej väzby.
